От кратера на изгасналият преди милиони години вулкан „Кожух“ извират термални води с температура около 74° С, които са известни с лечебните си свойства в цяла България. Всъщност не точно от кратера, а от скали от дълбока разломна зона образувана в края на геоложката епоха Палеоцен. От същата епоха в тези скали е внедрен и вулкан Кожух. Лечебната, минерална вода на Рупите по съдържание се характеризира като високо минерализирана, хипертермална, хидрокарбонатна, натриева, флуорна и силициева. По химичен състав съдържа в определени количества някои от микроелементите: алуминий, арсен, мед, олово, селен, цинк, барий, бор и цианиди.